机床在运行过程中出现故障是常有的事，而且通常都会直接表现在工件上，使得工件出现加工精度误差。这对于数控双头机床也是一样的，有时候就是可以通过加工工件存在的精度误差，来确定设备的故障。但这么做也是有一定前提的，比如：

首先要注意数控双头机床传感器的安装部位，而且其导线进行采用短线；其次，数控双头机床的主轴轴频尽可能不要采用50、25、16；另外在测试的时候，一定要确保各个紧固件是处于拧紧状态，特别是电机座架、油泵底座处的固紧件。
如果在这过程中机床出现各种异常情况，一定要将设备停运，避免使故障严重化。在后期的分析过程中，需要在非运转状态下进行信号识别和剔除。